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國家海洋研究院進行原始資料蒐集、與資料正規化，例如轉換為SHP檔或數值等格式，同時建立圖資的時間與空間屬性，以整合成國家海洋資訊圖資。整合後的資料再根據資料特性，整合進主題空間資料庫。為遵循「達爾文核心集（Darwin Core）」與國際地理資訊系統協會（Open Geospatial Consortium, OGC）的技術標準規範，發展自動化整合工具，進行標準化後，將整合後的資料進一步整合至空間資訊圖資資料庫，以提供更多應用加值服務。
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